Henrique se formó en las categorías inferiores del Club de Regatas Vasco da Gama, club en el que ha desarrollado gran parte de su trayectoria profesional jugando, a lo largo de las temporadas, partidos de Série A y B en el campeonato Brasileiro, campeonato carioca, Copa Libertadores, Copa Sudamericana y Copa do Brasil. Además, el futbolista fue internacional con la selección sub20 brasileña. Tras más de ocho años en el Vasco da Gama, uno de los clubes más importantes en Brasil y enraizado en Río de Janeiro, Henrique Silva fichó por el Olympique de Lyon francés con el que a lo largo de tres temporadas disputó choques en Ligue 1, Copa de Francia y UEFA Europa League. Ahora afronta un nuevo reto en el Pucela.

Categorías inferiores del Vasco da Gama

14-21: Vasco da Gama

21-24: Olimpique de Lyon

Marzo 25-actualidad: Real Valladolid